| 宮古島東急リゾート | 宮古空港より車で10分 |
| スーパーホテル石垣島 | 石垣空港からバス（２００円）で２６分、タクシー（１０００円）で１０分。 |
| ホテル共和 | 宮古空港から車で１３分。 |
| 石垣全日空ホテル＆リゾート（タワー＆パティオ館） | 石垣空港から車で５分 |
| ホテル日航八重山 | 石垣空港より車で約8分 |
| 南の美ら花 ホテル ミヤヒラ | 石垣空港よりタクシーで１０分。 |
| ホテルアトールエメラルド宮古島 | 宮古空港より車にて約10分 |
| シーマンズクラブ リゾートホテル | 空港よりタクシー３０分 川平リゾート線９０分 |
| ミヤコセントラルホテル | 宮古空港よりタクシーにて１２分。 |
| ホテルルートイン グランティア石垣 | 石垣空港より車で１２分 / 石垣港より徒歩15分 |
| ホテル ピュアタウン大石 | 石垣空港より車で10分 |
| ラ・ティーダ西表 | 西表島大原港より車で５分（送迎有要予約） 石垣発の船の時間をお知らせください。 |
| ホテル ハーバー石垣島 | 石垣空港から車で約7分 / 離島桟橋より徒歩０分 |
| 宮古第一ホテル | 宮古空港より車で１５分 |
| 大原ホテル | 石垣空港よりバス空港線２０分『東運輸バスターミナル』下車又はタクシー１０分 |
| ビーチホテル サンシャイン | 石垣空港からタクシーで約15分約1400円 |
| ペンション イリオモテ | 石垣島より高速船にて西表島「船浦港」へ バス停「月ヶ浜」下車 |
| ペンション ぱいらんど | 石垣空港よりタクシーで１５分 / 離島桟橋より徒歩２分 / 石垣バスターミナルより徒歩１分 |
| 松金ホテル | 沖縄本島『運天港』よりフェリーで『伊平屋村前泊港』徒歩10分 |
| 民宿よなぐに荘 | 石垣空港より車で約１０分 / 市街地より車で５分 |
| 民宿 八重山荘 | 石垣空港よりおバスで２０分『桟橋通り』下車 |
| 民宿あみもと（久米島） | 久米島空港より35分 |
| ホテルニュー丸勝 | 宮古空港から車で約15分 |
| ホテルニューいらぶ | 宮古島マリンターミナルから船で１０分 伊良部島着 後バスＯＲタクシー |
| ロイヤルマリンパレス | 石垣空港より車で１5分 |
| リゾートペンション クルー | 宮古空港より車１０分 |
| 観光ホテル セイルイン宮古島 | 宮古空港より車で１０分 |
| ホテル アイランドコーラル | 宮古空港よりお車にて約１５分。平良港より徒歩１０分。 |
| 民宿 あや乃荘 | 石垣空港・石垣港よりお車（タクシー）で５分／送迎有 |
| スーパーホテル アビアンパナ石垣島 | 石垣空港よりタクシー１０分 空港バス２０分 |
| 石垣全日空ホテル＆リゾート（サンコースト館） | 石垣空港より車で5分 |
| ホテル ピースランド石垣島 | 空港から車で10分 |
| ホテル サンフラワー＜沖縄県＞ | 渡嘉敷港より車で１５分／那覇空港より泊港まで１５分・泊港より高速船で３５分 |
| ペンション 赤かわら | 石垣空港〜【車で１５分/タクシー料金￥1,200】【バスで“空港線”経由“川平線”ロイヤルマリンパレス下車、120m先 |
| 民宿 石水亭 | 宮古空港より車で１５分／平良港より車で５分 |
| なかのや旅館 | 宮古空港よりお車で１５分／平良港より５分 |
| ネイチャーホテル パイヌマヤリゾート | 大原港より車（バス・レンタカー・タクシー等）にて３０分 |
| 宮古島ユースホステル | 宮古空港から車で１０分 |
| 民宿 サンルーム | 宮古空港から車で5分 |
| ペンション 湧泉家 | 宮古空港よりお車で３分 |
| コンドミニアム ビーチコマー | 座間味港／那覇の泊港からフェリー、高速船／那覇空港から飛行機 |
| ゲストハウス 美ら海（ちゅらうみ） | 宮古空港より車使用で約５分 |
| コラボレーションホテル | 石垣空港：車１０分／バス：バスターミナル（石垣空港発２００円１５分）徒歩２分／離島桟橋へ徒歩５分／石垣市役所徒歩０．３分 |
| 西表サンクチュアリーリゾート ニラカナイ | 石垣港より高速船４０分で西表島船浦港又は上原港へ 船浦・上原港より送迎バスで約１０分 |
| 海のなかま ダイビングサービス＆ペンション | 石垣島空港〜お車で約１２分 |
| ホテルイーストチャイナシー | 石垣空港〜お車で７分 |
| イーフビーチホテル | 久米島空港より路線バスにて３０分・タクシーにて２０分 |
| ホテル ていだの郷 | 宮古島の平良港より伊良部島佐良浜港まで高速船１５分。港からタクシー１０分 |
| 宮古島センチュリーマンション | 宮古空港からタクシーで５分 |
| ペンション ジロー村 | 宮古空港まで車で約１５分／平良港まで車で約５分 |
| 民宿 さんご星 | 石垣空港より車で１5分／バス 白保中学校下車 徒歩５分 |
| ホテル日航 久米アイランド | 久米島空港より車で２０分 |
| ペンション ぷちハウス | 石垣空港より車で５分／石垣港より徒歩５分 |
| ペンション スター | 宮古島空港より車で１５分 |
| ドームハウス おなが館 | 石垣島空港から車で２〜３分 |
| キャッツ イン ケラマ | 座間味港／沖縄県那覇市の泊港から船で座間味港へ。港から徒歩３分 |
| 宮古島ペンションオレンジＢＯＸ | 宮古空港より車で１５分位／港から徒歩１５分位 |
| 民宿 とのしろ | 離島桟橋より徒歩２分 |
| ペンション アイランドリゾート | 空港より車で１２分（観音堂線−唐人墓方面） |
| マリンロッジ・マレア | 宮古島空港より車で１５分 |
| ホテル南西 | 石垣港より車で５分 |
| ペンションＭＵ | 宮古空港より車で１０分 |
| ダイブイン浜 (ダイブイン ハマ) | 座間味港より徒歩２分 |
| リゾートハウス みなみ | バスにてイーフビーチ前（バス停）より徒歩１分 |
| 民宿 浜田 | 那覇泊港より・北岸 クイーンざまみ１時間・南海 フェリーざまみ２時間 |
| ペンション マリンパレス | 渡嘉敷港 より送迎車有り 車で１５分 |
| 海すずめ | 石垣空港・港より車で送迎できます(有料） |
| ホテルマリンテラス久米島 | 久米島空港より路線バスにて３０分、タクシーにて２０分 |
| アジアン | 石垣空港よりタクシーで１５分/離島桟橋より徒歩１０分 |
| ペンション エクレシア | 石垣島空港より車で１５分 |
| コンドミニアム 海の詩 | 平良港より車で５分／荷川取漁港より徒歩１分／宮古島空港より車で１５分 |
| 民宿 マリウド | 船浦港より車で２分、徒歩で１０分 |
| ホテル星立 | 西表上原港/船浦港より車で１５分 |
| フサキリゾートヴィレッジ | 石垣空港より車で２０分 |
| ペンション 美崎 | 石垣空港より車にて５〜１０分 |
| 花と緑の宿 みずほ | 石垣空港より車で５分・離島桟橋より車で10分(無料送迎あり・要電話予約) |
| 民宿 船頭殿 | 座間味港より徒歩２分 |
| ベストイン石垣島 | 石垣空港から車で３分／離島桟橋から車で５分/空港より８分「ベストイン石垣島」バス停あり（空港線 一律200円）。 |
| ペンション くば | 阿嘉港より徒歩５分 |
| マリンスターイン＆スパリゾート | 石垣空港より車で２０分 |
| ホテル プレミア | 平良港から徒歩８分／空港からタクシーで１５分 |
| 西表サンクチュアリーリゾートニラカナイ（南西楽園ツーリスト提供） | 石垣島から高速船で約４５分／船浦港から車で約１０分 |
| リゾートヴィラ ブリッサ（南西楽園ツーリスト提供） | 宮古空港から車で約１０分 |
| ホテルブリーズベイマリーナ（南西楽園ツーリスト提供） | 宮古空港から車で約１０分 |
| シギラ ベイサイドスイート（南西楽園ツーリスト提供） | 宮古空港より車で約１５分 |
| ラグーンスイートヴィラ アラマンダ（南西楽園ツーリスト提供） | 小浜港より車で約１０分 |
| ヴィラ ハピラパナ（南西楽園ツーリスト提供） | 小浜駅より車で約５分 |
| プチホテル いさ | フェリーあぐに 那覇（泊港）から約２時間／ＲＡＣ（琉球エアコミュータ） 那覇から約２５分 |
| ペンション はまゆう | 那覇市在の泊港より座間味村航路船にて来島。所要時間クィンざまみで５０分、フェリーざまみで１８０分 |
| スリープイン 石垣島 | 石垣空港より車で１２分。離島桟橋より徒歩９分。 |
| ペンション ＴＡＫＡＴＳＵＫＩ | 泊港より船で座間味港へ。座間味港より徒歩５分 |
| ペンション 華 | 宮古空港より車で５分 |
| 軽井沢倶楽部 ホテル石垣島 | 石垣空港より車で１０分 |
| ハマユウ荘 うふあがり島 | 北大東空港より車で７分 |
| 民宿 宝生 | 阿嘉港から車で１分、徒歩で３分 |
| サンセット イン マレイド | 石垣空港から車で３０分 |